Banki przeprowadzają kontrole, które klienci wpłacają wraz z nimi. Dział kontroli czeków banku dokonuje kontroli. Według amerykańskiego Banku Rezerw Federalnych w Nowym Jorku korzystanie z czeków papierowych jest zastępowane przez metody płatności elektronicznych, a liczba czeków pisanych w Stanach Zjednoczonych spada od połowy lat dziewięćdziesiątych. Niezależnie od tego, czy czek jest przetwarzany w formie czeku papierowego, czy też przetwarzany elektronicznie, funkcja banku w rozliczaniu czeku pozostaje taka sama.
Same kontrole bankowe
Kontrole te, zwane czekami "on-us", są zdeponowane i wystawione na tej samej instytucji finansowej. Stanowiły one 20 procent czeków wypłaconych w 2006 r., Według Federal Reserve Bank of New York. Aby usunąć kontrole "na żywo", bankowy dział rozliczeń banku dokonuje odpowiednich wpisów w swoich księgach, aby zasilić konto deponenta i obciążyć rachunek płatnika.
Czeki międzybankowe
Są to kontrole, które są zdeponowane i wystawione na dwóch różnych bankach. Tego rodzaju kontrole stanowiły 80 procent czeków wypłaconych w 2006 r., Według Federal Reserve Bank of New York. Aby wyczyścić te kontrole międzybankowe, bankowy departament rozliczeń czeków może przedstawić kontrole bezpośrednio bankowi, na który czek zostanie wystawiony, lub przekazać go korespondentowi do odbioru. Może również wymieniać kontrole z grupą banków uczestniczących w porozumieniu dotyczącym izby rozrachunkowej. Może też przekazać czek do banku Rezerw Federalnych w celu odbioru.
Przetwarzanie elektroniczne
W ostatnich latach liczba kontrolowanych czeków spadła i wykorzystuje się więcej elektronicznych płatności. Dzięki elektronicznemu przetwarzaniu banki nie muszą transportować ani przetwarzać czeków papierowych. W oparciu o ten trend banki Rezerwy Federalnej redukują liczbę miejsc, w których przetwarzają papierowe kontrole. Ruch w kierunku elektronicznego przetwarzania czeków zyskał trakcję dzięki sprawdzaniu rozliczeń w związku z ustawą z 21 wieku z 2004 r. Ustawa ta wprowadziła pojęcie czeku zastępczego, będącego papierową kopią przodu i tyłu czeku, który jest prawnym odpowiednikiem oryginalna kontrola papieru. Ustawa z 2004 r. Zezwalała bankom na przetwarzanie czeków drogą elektroniczną, z zastrzeżeniem, że jeśli podczas rozliczania czeku napotkają instytucję, która wymaga kontroli papierowej, dostaną czek zastępczy.